中國有機產品認證屬于產品認證的范疇，根據《中華人民共和國認證認可條例》、《有機產品認證管理辦法》（國家質量監督檢驗檢疫總局2004年第67號令）和中國合格評定國家認可委員會相關認可準則CNAS—CC23：2006《〈產品認證機構通用要求〉有機產品認證的應用指南》的要求以及國際通行做法，有機認證程序一般都包括認證申請和受理（包括合同評審）、文件審核、現場檢查（包括必要的采樣分析）、編寫檢查報告、認證決定、證書發放和證后監督等主要流程。

       申請者書面提出申請認證時，根據《有機產品認證實施規則》的規定，應向有機認證機構提交下列材料：① 申請者的合法經營資質文件，如營業執照、土地使用證、租賃合同等；② 申請者及有機生產、加工的基本情況，如申請者名稱、地址和聯系方式，生產、加工規模，包括品種、面積、產量、加工量等描述；③ 產地（基地）區域范圍，包括地理位置圖、地塊分布圖、地塊圖；④ 申請認證的有機產品生產、加工、銷售計劃；⑤ 產地（基地）、加工場所有關環境質量的證明材料；⑥ 有關專業技術和管理人員的資質證明材料；⑦ 保證執行有機產品標準的聲明；⑧ 有機生產、加工的質量管理體系文件；⑨其他相關材料。

       按照國家質檢總局《有機產品認證管理辦法》、國家認監委《有機產品認證實施規則》等法律法規和GB/T19630《有機產品國家標準》，企業要想將自己的產品作為有機產品銷售，必須通過有機認證。從事有機產品認證的機構必須獲得中國國家認證認可監督管理委員會（簡稱國家認監委，英文縮寫CNCA）的批準。國家認監委（CNCA）網站上對獲批的認證機構給予公布。只有獲得CNCA批準并與公布的認證機構才是合法的可從事認證活動的機構。可以在CNCA網站查詢其批準的認證機構目錄，具體辦法為CNCA網站——綜合服務專區——機構查詢——認證機構名錄——選擇有機產品（共分植物、畜禽、水產和加工四類）。

       公眾還可以通過在CNCA網站的“食品農產品查詢”服務區查詢全國食品農產品認證企業名錄及其認證產品等信息。

       按照農業部綠色食品、無公害農產品、有機食品認證工作“三位一體、整體推進”的戰略部署，有機食品認證程序及有機食品標志已正式啟用。